乙肝小三阳很少会出现自愈的情况，因为目前还没有任何的药物或者食物能够彻底清除机体的乙肝病毒，大部分乙肝携带者都处于终身携带病毒的状态。
乙肝小三阳携带者在定期的随访中，如果没有肝炎的发作和健康的人群是一样的，寿命也不会受到任何影响。
乙肝小三阳患者在定期体检当中，如果出现肝炎的发作，就需要口服抗病毒药物进行治疗。
一线的抗病毒药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展，并且降低肝癌的发生概率。