对于大三阳的患者，一般说明病毒有复制，大多数多合并肝功能损害。此时应进一步抽血查乙肝DNA，看病毒有没有复制。如果患者DNA提示病毒有复制，而且合并肝功能谷丙、谷草转氨酶的升高，此时多考虑患者处于乙肝病毒复制的窗口期，需要积极的抗病毒治疗。
一般可以选择注射干扰素治疗半年到一年左右的时间，也可以考虑口服抗病毒的药物，如拉米夫定、阿德福韦酯等药物，一经服药，需要长期服药，一般在中间治疗期间不能停药，停药以后有可能发生戒断反应，引起病毒复制的加剧以及肝功能的损害。
对于大三阳的患者，首先需要积极的控制病毒复制，在积极治疗半年以后复查乙肝DNA，看病毒复制是否已经控制。如果已经控制，积极的保肝治疗之后，患者多可趋于平稳，注意多休息，不要熬夜，不要劳累，不要饮酒即可。