浅表器官彩色多普勒超声可以检查腮腺、颌下腺、甲状腺、甲状旁腺、乳腺、睾丸，以及颈部淋巴结、腋窝淋巴结、腹股沟淋巴结、皮下包块。
可以诊断腮腺炎、颌下腺炎、甲状腺炎、乳腺炎、睾丸炎，观察诊断甲状腺囊肿、结节性甲状腺肿、桥本氏甲状腺炎、甲状腺腺瘤、甲状腺恶性肿瘤以及乳腺纤维腺瘤、乳腺囊肿、乳腺脓肿、乳腺恶性肿瘤。
可以诊断睾丸内囊肿以及睾丸内恶性肿瘤、脂肪瘤、表皮样囊肿等疾病，还可以诊断颈部动脉、锁骨下动脉、椎动脉、四肢动脉的斑块、狭窄及闭塞症，还有四肢静脉血栓。