颅底凹陷是指枕骨大孔周围的颅底骨质向上陷入颅腔，迫使其下方的寰枢椎升高进入颅底，可以合并这个区域的骨骼发育异常或其他异常，还可以合并神经结构畸形，例如Chiari畸形、小脑扁桃体下疝畸形和脊髓空洞等。单纯的颅凹陷，一般不会产生明显的症状，而如果颅底凹陷合并了上述神经结构畸形和异常，患者可以出现节段性分布的痛温觉障碍，以及触觉和深感觉保留的分离性感觉障碍，个别严重的患者，还可以出现手部掌间肌和鱼际肌的萎缩。