绝大多数的手足口病都不是重症，在一个星期左右的时间症状都能够完全消退。手足口病在最后2-3天的时候就是它的恢复期，有时候这个时间也有可能稍微长一些，主要根据皮疹的多少，在这一时间内已经不会出现发烧的现象。
关于咽痛，在最后的1-2天也会逐渐消退并减轻，在第3-4天的时候咽痛最厉害，有的患儿甚至不能吃饭喝水。而在恢复期的1-2天或者2-3天之内就能够好转，开始能够吃饭喝水，咽痛恢复的程度还是比较快。
手足口病的皮疹在总共病程的第3-4天达到高峰，恢复期不会有新的皮疹再出现，红色的丘疹会直接消退掉，疱疹不会破溃，而是结一层硬皮病慢慢消退掉。有些手足口病的疱疹会比较多，消退的时间会稍微延长，可能会在3天左右甚至更长。