男性性功能障碍最常见的是阳痿和早泄，阳痿、早泄占据了男性性功能障碍中的一大部分。
对于阳痿、早泄目前可以通过药物进行治疗，阳痿和早泄属于两种疾病，所以治疗药物也不一样。阳痿患者通过药物治疗，可以改善海绵体的血液供应，从而增加勃起硬度和勃起持续时间。临床上常用的药物主要有万艾可、希爱力等。
早泄患者主要是由于龟头敏感，射精控制力差引起的，对于早泄目前常用的药物主要有盐酸达泊西汀、舍曲林、帕罗西汀等，这类药物可以提高患者中枢神经对射精的控制力，从而延长性生活时间。另外一些常用的中成药物，如玄驹胶囊、舒肝益阳胶囊等，对于阳痿、早泄也有一定的治疗作用。