脑神经功能中度障碍，可以通过以下几种方式进行治疗。建议在医生的指导下应用神经营养药物，应明确脑神经功能障碍就是神经衰弱，是精神心理方面疾病的表现，由于生物钟紊乱而导致的大脑机能长期兴奋，而引发的过度疲劳，这种情况可以应用神经营养药物进行调节。
如果情况比较严重，应在医生的指导下应用苯二氮䓬类、非苯二氮䓬类的抗焦虑抑郁的药物进行专业治疗，应当到专业的医生那里明确是否有焦虑、抑郁情绪以及严重程度，并且选择合理的药物进行治疗。