如果出现病毒性肠胃炎时，婴幼儿症状比较重，大龄儿童和成年人多为轻型。该病临床上一般为急性起病，常常伴有低热、恶心、呕吐，继之出现腹泻，粪便多为水样或者黄绿色的稀便，一般没有黏液和脓血，大便次数多少不一，有时3-5次，或者数十次不等。严重腹泻的患者会出现脱水和电解质紊乱，以及代谢性酸中毒，更严重者会危及生命。部分患者还会有咳嗽、流涕等上呼吸道感染的症状。
病毒性肠胃炎多见于轮状病毒、诺罗病毒以及肠腺病毒的感染，临床表现十分相似，实验室检查主要有白细胞轻度升高，部分患者白细胞正常。粪便常规检查多见于黄色水样便，一般没有明显的脓细胞和红细胞，少数患者会有少量的白细胞，治疗上主要针对腹泻和脱水进行对症治疗，一般不用抗菌药物。