偏头疼的治疗主要分为两个方面：
一、针对偏头疼发作时，主要以对症治疗，可以适当口服非甾体类消炎药，如布洛芬，还有常用的药物有麦角类药物，麦角胺和曲普坦类药物如舒马曲普坦，如果仍无效，则需要阿片类药物止痛，但易产生依赖性，不能长期使用。肉毒毒素头部注射可以缓解偏头痛，并于 2010年分别被英国和美国FDA批准用于预防性治疗慢性偏头痛的首选药物。
二、预防偏头疼的发生，主要是帮助患者确立战胜疾病的信心，保持健康的生活方式，寻找并避免各种偏头疼诱因，如精神紧张，心理压力大、睡眠不足、噪音和强烈气味饮食。应戒烟戒酒和辛辣刺激性食品，不吃巧克力、咖啡等可能引起血管收缩、增加头部疼痛的食品。