鼻窦炎分为急性鼻窦炎和慢性鼻窦炎，急性鼻窦炎应首选抗生素，抑制细菌繁殖。
急性鼻窦炎多为球菌、杆菌和厌氧菌感染，故应首选并足量使用青霉素类抗生素。如果病人对青霉素过敏，或细菌对此类抗生素具有抗药性，可改用其他广谱抗生素或磺胺类药物。
其次，局部治疗药物可以用1%的麻黄碱滴鼻液滴鼻和辅舒良、内舒拿喷鼻，麻黄碱类药物属于鼻腔减充血剂，不能应用太长时间，一般不超过一周，而辅舒良这种激素类药物适合长期使用，局部鼻喷药有助于窦口开放、炎症消失和脓液引流。
配合中成药物，如鼻渊通窍颗粒、鼻渊软胶囊。对于慢性鼻窦炎，治疗时不需要应用抗生素，可以应用局部鼻喷药物，加上中成药即可。