做腱鞘囊肿手术切除会有轻微的疼痛，同选择的麻醉方式有直接关系。如果选择的是臂丛神经麻醉，不用担心，手术肯定不会疼的。如果是长在足背下肢的腱鞘囊肿，选择的腰硬联合麻醉手术也不会疼。无论是手背还是手腕还是足背的腱鞘囊肿，绝大多数都会选择局部浸润麻醉，在手术的术中会有非常轻微和短暂性的疼痛。由于局部浸润麻醉，并不能够将所有的部位彻底麻醉，腱鞘囊肿的底部通常没有办法麻醉，所以在切除腱鞘囊肿的时候会有一定时段感觉疼痛。