治疗肾积水有内科办法，也有外科办法。内科办法多用于治疗泌尿道感染或者结石梗阻引起的，用抗生素治疗，可以行中段尿微生物培养，根据药敏结果选择敏感的抗生素治疗两周。如为单独的泌尿道感染引起的，治疗后肾积水可消失。如为结石引起的，可以待感染控制稳定后，行体外冲击波碎石或者手术取石治疗。对于外科的肾积水，一般是结石或肿瘤压迫引起的，此时可以插入导尿管或者植入输尿管支架，行手术取石治疗。通常解除梗阻后肾积水可消失，肾功能也可以完全恢复正常。治疗肾积水的目的，是防止因为肾积水反复出现尿路感染，及肾积水压迫正常肾组织而影响肾功能，造成不可逆转的后果。