输尿管结石如果出现腰部或者是上腹部剧烈的疼痛，需要及时就医，在明确诊断之后，可以用止痛的药物快速的缓解疼痛。但这并不是止痛的根本方法，只有当结石排除之后才能有效的止痛。
对于比较小的输尿管结石，可以通过增加饮水量，适当活动，口服消炎和排石的药物，以促进结石的排出。对于比较大的结石，需要采用体外冲击波碎石或者是微创手术进行治疗，体外冲击波碎石是一种体外碎石的方法，应用高能冲击波将结石粉碎成易排出的细小结石。微创手术采用经尿道逆行途径，在监视器直视下，通过内腔镜在输尿管找到结石，然后将结石粉碎成容易排出的细小碎石。只有将结石彻底的清除，才能彻底的解除疼痛。