通常扁桃体肥大只要不引起症状不用治疗，但引起呼吸的阻塞、反复发炎时等可能需要手术。小孩的扁桃体肥大是很正常的现象，通常扁桃体在10-14岁萎缩，在这之前多数的孩子扁桃体都会肥大。扁桃体的功能是防御功能和免疫功能，所以在小孩体内会是人体的防线。
因为它有防御功能和免疫功能，对身体起到保护的作用。如果扁桃体反复的发炎，可能会导致扁桃体形成慢性的炎症，这时候防御功能和免疫功能就会下降，有的还可能会造成远期并发症，比如风湿性心脏病、风湿性关节炎或肾炎，这种情况需要做扁桃体的切除。