肺孢子菌肺炎的治疗，首选药物是复方磺胺甲恶唑片，也就是常说的SMZ。肺孢子菌肺炎是HIV最常见的机会性感染之一，也是最主要的死亡原因之一。当然，对于一些免疫功能低下或免疫缺陷的病人，也是容易感染肺孢子菌肺炎的。肺孢子菌肺炎的首选治疗药物当然是SMZ，但是对于严重的病人或是对SMZ效果较差的病人，可以联合棘白菌素类也就是常说的卡泊芬净，进行联合抗菌治疗，疗效对于单药可能效果更好。一些合并有呼吸衰竭的病人，可以适当的用激素类的药物。