头颅磁共振检查只是诊断脑瘫的辅助检查之一，但并不能单靠头颅磁共振检查的结果来确立或者排除脑瘫，部分脑瘫患者可能有头颅磁共振异常。
头颅磁共振检查对于脑瘫的患者主要是了解是否有脑部结构的异常，脑部功能磁共振检查还可以看是否有脑部发育的异常。头颅磁共振检查正常也不能排除脑性瘫痪，头颅磁共振检查异常也不一定就会有脑性瘫痪。
所以脑瘫患者只通过头颅磁共振检查是无法确诊的，脑瘫的诊断主要是依靠临床症状和体征来诊断，比如婴儿出现肢体瘫痪、肌张力升高，伴有智能低下、行为异常、癫痫发作的情况。
在排除其他进行性疾病导致的中枢性瘫痪后就考虑脑瘫的可能，除了头颅磁共振，还可以做脑电图排除癫痫，完善诱发电位排除视听发育异常。