吸入性肺脓肿主要的致病菌是厌炎菌，主要的特征是痰中有臭味，同时也可以合并革兰氏阴性杆菌，革兰氏阳性球菌的感染。
如果患者确诊为肺脓肿后，首选抗生素的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，例如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等等，同时可完善痰培养的检查，根据药敏结果试验更换抗生素。
除使用抗生素治疗以外，还要注意痰液的引流，包括体位引流和使用祛痰药物，例如氨溴索、桉柠蒎、乙酰半胱氨酸等等。
必要时可以考虑介入或者是手术的治疗方法。同时建议多吃青菜和水果，提高患者的机体免疫力，促进疾病的恢复。