头孢克肟与头孢地尼都属于第三代头孢菌素类的药物，其抗菌谱都比较广，但是头孢克肟对于革兰阴性菌的抗菌效果会更好一些，而对于革兰阳性菌，例如葡萄球菌，抗菌效果就会稍微差一些。
头孢克肟对于淋球菌的抗菌效果非常好，临床上可以用作淋菌性尿道炎的首选治疗药物。此外，头孢克肟在胆囊组织中的穿透性比较强，因此可以用于胆道感染的治疗中。
而头孢地尼对于革兰阳性菌，例如金黄色葡萄球菌或者链球菌的抗菌效果会更好一些。因此，这两种药物具体选择哪一种药物来治疗，要根据患者的感染类型以及细菌培养、药敏试验的结果来进行选择，这两种药物通常都是口服制剂。