新生儿高胆红素的病因，按照高的结合胆红素血症和高的未结合胆红素血症来分，可以分为如下：
1、高结合胆红素血症，也就是直接胆红素增高的，有新生儿宫内感染，如巨细胞病毒感染、新生儿梅毒、胆道闭锁、新生儿肝炎、各种原因导致的新生儿胆汁粘稠综合征、胆总管囊肿及半乳糖血症等；
2、已高的未结合胆红素增高的，常见的有ABO溶血病、Rh溶血病、红细胞膜形态的异常，如球形红细胞增多症、椭圆形的红细胞增多症、血红蛋白病、新生儿出血、胎粪排出延迟、母乳性的黄疸、甲状腺功能低下、红细胞增多症或者是早产儿等。