维生素B1在人体内参与多种物质的代谢，特别是能参与糖类的分解代谢，还能促进胃肠道蠕动增加食欲。另外它具有保护神经系统的作用。
人体缺乏维生素B1可能会出现一些神经系统的病变，例如会有肢端麻木、肌肉萎缩甚至出现神经退化、神经炎等表现，此外缺乏维生素B1还会引起脚气病，临床上补充维生素B1可以用于治疗以上这些情况。
除了脚气病还有神经性的疾病之外，还能治疗缺乏维生素B1导致的营养不良、厌食等情况。对于一些神经官能症使用维生素B1也有辅助治疗的效果，特别是有慢性胃炎或者是肠易激综合征以及一些胃肠道蠕动功能的障碍，都可以使用维生素B1来进行辅助治疗。