牙周炎的治疗是综合的序列治疗，首先要进行牙周炎的基础治疗，去除局部的致病因素，控制菌斑，消除牙结石，控制牙龈的炎症，在此基础上才能再进行进一步的治疗。
基础治疗过程中，必要的时候还要拔除不能保留的患牙，而且要戒烟以及控制全身疾病，包括糖尿病等系统性疾病的干预。在进行基础治疗之后，必要的情况下，还要进行牙周的手术治疗，以及必要的修复治疗，建立一个稳定的咬合关系，减少对松动牙的影响。
在经过以上治疗之后，要转入牙周的支持治疗，也就是维护期，包括要定期的复查，根据复查的内容及时的发现问题，及时的再治疗，使得牙周炎治疗的效果能够长期的维持。