乙肝的功能性治愈也就是临床治愈，是指在乙肝的抗病毒治疗过程中，出现了乙肝表面抗原转阴，产生了乙肝表面抗体或未产生乙肝表面抗体，乙肝病毒DNA检测不到，肝脏生化学指标正常，停药后仍保持不变的，肝穿肝脏组织病变有改善的。
即达到了乙肝的功能性治愈，但是患者肝细胞核内的病毒未被清除，仍存在复发的可能。
对于应用化疗药物或免疫抑制剂治疗的患者，应每1-3个月做1次ALT、乙肝病毒DNA和乙肝表面抗原检查，一旦乙肝病毒DNA或乙肝表面抗原转为阳性，应立即给予抗病毒治疗。