膀胱癌手术以后需要进行化疗，对于保留膀胱的膀胱腔内微创手术治疗后的患者，需要进行膀胱灌注化疗。对于膀胱全切的患者，如果存在血管内的瘤栓，则需要使用全身静脉化疗进行治疗。绝大多数患者都采用膀胱灌注化疗。
也就是将化疗药直接通过尿管灌注进膀胱之内，保留一定的时间再排出体外，让化疗药物充分与膀胱黏膜接触，杀灭可能潜在的癌细胞，降低膀胱癌复发的概率。如果是膀胱全切手术的患者，则需要将化疗药直接静脉注射入人体内。
通过血液带至全身各处，杀灭血液中潜在残存的癌细胞，防止远处转移的概率。但膀胱即便经过化疗以后仍然有部分患者对化疗不敏感，还可能会存在转移或者复发的情况，所以即便经过化疗也需要终身随访。