新生儿小肠闭锁术后如果没有术后的并发症，在术后两周达到全肠道内喂养的时候可以出院。如果有术后并发症，像合并有肠粘连、肠狭窄，此时达到全肠喂养的时间可能就会延长，住院时间相对就比较长，所以有并发症的患儿，在术后两周不能完全达到出院的指征。
如果没有相应的并发症，预后比较好，术后一周之后逐渐开奶，基本上到术后第两周能够达到全肠道内的喂养，此时可以达到出院指证，所以根据新生儿肠闭锁的程度，也就是闭锁范围以及术后有无相关的并发症，才能决定新生儿肠闭锁术后住院时间，可能会有个体差异。