肾积水伴结石性肾盂肾炎比较严重，如果不治疗，可能会引起严重的化脓性肾感染，也有可能会导致肾功能持续性下降，最终导致肾脏萎缩，常见治疗如下：
1、抗感染治疗：主要是根据尿培养的结果，选择敏感的抗生素来控制肾盂肾炎。一般是选择头孢曲松针剂、左氧氟沙星针剂等，静脉注射治疗一段时间。
2、碎石或排石治疗：控制好炎症后，需根据结石的大小选择碎石或排石方案。通常小于1cm的结石，建议采用体外震波碎石，将结石粉碎后排出，肾积水会消除。如果是直径大于1cm的结石，一般需要通过输尿管软镜或者是经皮肾镜激光碎石的方法，才能够把结石粉碎、排出。