宫外孕疼痛的部位大多是在下腹部的左侧或右侧，但是根据宫外孕病人病情的严重程度，疼痛的范围和部位有所不同、有变化。
输卵管妊娠发生流产或破裂之前，由于胚胎在输卵管内逐渐增大，常常表现为一侧下腹部隐痛或酸胀感。当发生输卵管妊娠流产或破裂时，突感一侧下腹部撕裂样疼痛，常伴有恶心、呕吐。如果血液局限于病变区，主要表现为下腹部疼痛，在左侧或右侧。当血液积聚在子宫直肠陷凹的时候，可以出现肛门坠胀感。随着血液由下腹部流向全腹，疼痛可以由下腹部向全腹扩散，血液刺激膈肌可以引起肩胛部的放射性疼痛以及胸部疼痛。