肠套叠的三大临床症状是腹痛、血便和腹部肿块。表现为突然发作的激烈的阵发性疼痛，患者经常有阵发性的哭闹不安，间歇期就像正常人一样安静如常，伴有呕吐和果酱样的血便。腹部触诊可以摸到腊肠形的表面光滑的稍微可以活动的肿块。这个肿块经常有压痛，位置常常位于脐的右上方，而右下腹触诊是比较空虚的。随着病情的进一步发展可以出现腹胀等肠梗阻的症状。