马蹄内翻足的病因至今还没有明确的科学定论。已经有学者在动物身上通过一些因素的干预能够诱导出马蹄内翻足一样的类似的畸形。目前比较公认的学说，马蹄内翻足跟基因有关系，同时基因又受到环境因素的刺激和影响。换句话说，它并不是医学上明确的单基因的遗传病，也就是并不能通过基因检测来确定孩子当中能够获病的概率到底是多少，但是已经有定论的是如果已经有马蹄内翻足的家族，子代发生马蹄内翻足的概率会比正常的人群要高出30倍。换句话说，如果你的第一个宝宝是有马蹄内翻足的，第二个宝宝未必会有。但是第二个宝宝发生马蹄内翻足整个风险的因素要比没有这些情况的家庭要高出大约30倍。