骶管囊肿手术的并发症，有可能会出现原先神经支配的区域，因为神经在术中有可能在显微镜下，虽然是手术很仔细，但也要器械碰它，所以术前疼痛或者不适的地方，术后出现麻木，这是相对比较常见的并发症。另外一些并发症，就是为什么术后需要卧位，趴着呆5-7天，因为伤口会容易出现积液，或伤口愈合不佳，因为骶尾部伤口相对肌肉少一点，如果早期下床活动，会影响到伤口愈合不佳，或者因为早期大便排出来以后污染伤口，容易出现伤口感染，这就是相对常见的并发症。