由于复发性口腔溃疡的病因不明，所以治疗方法虽然很多，但是还没有一种特别有效的方法来治疗口腔溃疡，可以通过一些其他的方法来辅助治疗口腔溃疡。首先，要注意保持口腔清洁，病情严重时，可以给予一些全身性的药物，特别是对于免疫功能异常的患者，应该积极接受治疗。其次，要注意保护口腔黏膜，避免咀嚼过硬食物，使口腔黏膜受到创伤。口腔溃疡的治疗，可以分为全身治疗和局部治疗。如果经过局部和全身的治疗，可以缩短口腔溃疡的发作期限，延长它的间隔周期。对于复发频繁以及病情严重者或者长期不愈的溃疡，可以考虑全身治疗以减少复发，并促进愈合。尤其是针对病因的治疗，比如细胞免疫功能低下的患者，可以给予患者一些免疫增强药物来进行治疗，以此提高疗效。