发现阴茎小一般可能提示两个问题，即勃起不充分和阴茎本身的短小。对于后者成年人无特殊的治疗方案，因为阴茎海绵体细胞不会继续分裂增殖，因此阴茎的长度无法通过药物改善。此类情况只能通过手术来治疗，即行阴茎延长术。
此手术是切断阴茎悬韧带，暴露埋藏于会阴部皮下的阴茎，其外观上看起来可能会延长增大，但是并不会改变阴茎本身的长度。对于勃起不充分导致的阴茎外观短小，一般可以通过口服药物改善，如磷酸二酯酶抑制剂，比如西地那非、他达那非等，也可以通过阴茎负压吸引装置，增多阴茎血流使得阴茎勃起改善，外观增大。