女性尿路感染引起腰疼、发烧，首先考虑是上尿路感染，比如肾盂肾炎、输尿管炎，需要进一步的检查尿常规、尿培养、泌尿系统的B超，或者是CT来明确诊断。一旦明确诊断，应该根据具体致病微生物的种类和药物敏感性选择敏感的抗生素，比如左氧氟沙星注射液、头孢曲松钠注射液，持续的静脉注射治疗一段时间，才能够彻底治愈上尿路感染。
在治疗期间也可以口服清热、利湿、通淋、利尿的中成药，比如三金片、热淋清胶囊、八正胶囊有很好的辅助治疗作用，同时每天应该喝水至少2000mL，充分的利尿有助于炎症快速康复。在症状没有完全消除之前，尽可能避免辛辣、刺激的饮食，不要喝酒，不要发生性行为。