对于3岁的孩子发烧在39度，这个时候属于高温的状态，可以采取物理降温的方法，用温热的毛巾给孩子不断地擦拭身体，达到降温的目的，同时也可以给孩子吃降温的药物，比如氨酚黄那敏颗粒或者泰诺林，都能达到降温的目的，同时对人体没有太大的副作用。如果在39℃，而且持续的时间比较久，一定要去医院查明原因，到底是因为感染还是因为其他方面所造成的，查明原因之后才能有针对性的加以治疗。