尖锐湿疣平均潜伏期是三个月之内，很少有超过数年。人大多数感染了人乳头瘤病毒都没有症状，有时很轻微或者是无法察觉，形成潜伏感染或者是亚临床感染。如果有症状，通常是在感染人乳头瘤病毒之后的2-3个月之内，出现肉眼可见的尖锐湿疣。极少数是在感染后的三周之内，或者是感染后的数年出现。
尖锐湿疣容易发生在性活跃的青年和中年，尖锐湿疣通常没有症状，少数患者有异物感、疼痛、瘙痒、性交不适、恶臭出血和明显的情感压抑。尿道内的尖锐湿疣，可以表现为终末血尿、尿流异常或者尿道出血。尖锐湿疣的位置、大小、形态各异，好发部位是外生殖器及肛门周围的皮肤黏膜湿润区域。