肠镜是诊断大肠病变的重要检查手段，在做肠镜之前要进行清肠操作，目前主要的操作方式是口服一些泻剂，通过缓泻使肠内的粪便尽可能排空，这为常见的检查提供一个良好的视野。
在进行肠镜的时候，医生会在肠镜上涂抹一些含有利多卡因的凝胶，既能够起到麻醉的效果，也能起到润滑的作用。在进入肠镜的时候，医生会让患者取侧卧位，将肛门镜轻轻的放入到肛门内，并嘱患者通过呼吸配合及体位的配合使镜子通过结肠、肝区曲、脾曲而达到回盲部。在镜子的检查过程中，患者如果属于清醒状态，会有一定的痛苦感受，尤其是在两个重要转弯时，患者很容易出现明显的腹痛。因此在做肠镜的时候，也可以选择带有麻醉的无痛肠镜，这样可以很好的缓解相关不适感觉。