午休起来心跳很快是交感神经和迷走神经进行神经调节对抗的结果，当人处于午休睡眠状态时，迷走神经的张力要高于交感神经的张力，迷走神经会使心率和血压处于较低的状态，心脏和其它重要脏器可以得到充分的休息。
当人醒来之后迷走神经和交感神经进行交接班，这时迷走神经占据下风，交感神经接管心血管的活动，而交感神经会让心率增快、血压升高，在交接班的过程中，心率由慢突然变快，人体会明显的感受到这种变化，但是这种变化很快就会过去。