大脑静脉窦血栓的治疗包括三部分，第一部分是病因治疗。病因治疗是治疗颅内静脉血栓的根本治疗之一，主要包括以下几个方面：第一、感染性疾病患者，应根据不同的病原体，及早选用敏感、足量、足疗程的抗生素进行治疗。第二、严重脱水的，应该进行补液治疗，维持水电解质平衡。第三、有自身免疫性疾病的，如系统性红斑狼疮、白塞病者，可予以激素治疗。第四、对于血液系统疾病，应给予相应的治疗，血黏稠度增高者，采用扩容、降低血黏度等治疗。第二部分是抗血栓治疗。一般选用抗凝、溶栓或者介入治疗。抗凝治疗越早越好，即使有小量的颅内出血或者产后1个月，也可以酌情使用，能明显降低死亡率，改善患者的预后。溶栓治疗一般选用尿激酶，目前来说，用尿激酶治疗，预后很好，而且安全性高，尚无证据表明其治疗优于抗凝治疗。还有介入治疗，随着介导技术的开展，出现了局部静脉内导管机械溶栓治疗和血管成形术，但这些新疗法有待于进一步评价。第三部分是对症治疗。比如颅内压增高者可应用甘露醇、甘油果糖、呋塞米、白蛋白等降低颅内压；有癫痫发作的，可以进行抗癫痫等对症治疗。