布氏杆菌病，一般预后良好，经规范治疗，大部分是可治愈的。在死亡病例中，主要的致死原因是心内膜炎，严重的神经系统并发症等。少数病例可疑留骨和关节的器质性损伤，使肢体活动受限。有的病例出现中枢神经系统后遗症，因诊治不及时、不彻底，所导致的慢性病例，其治疗较为复杂，部分患者治疗效果较差。
对于急性和亚急性感染，主要采用对症治疗和一般治疗。病原菌的治疗应选择能进入细胞内的抗菌药物，主要为多西环素及利福平。八岁以下的儿童可采用利福平联合复方磺胺甲恶唑治疗；孕妇可采用利福平联合复方甲胺，复方磺胺甲恶唑治疗；
对于合并中枢神经系统并发症必须采用易于渗透血脑屏障的药物，同时疗程应足够延长，应用多西环素、链霉素联合利福平或复方磺胺甲恶唑共6-8周，合并心内膜炎也可采用上述治疗方法，但常需同时采用瓣膜置换术，疗程也应适当延长；
合并睾丸炎，除采用多西环素联合利福平外，可短期加用小剂量糖皮质激素，合并脊柱炎应采用多西环素联合利福平可延长疗程至八周或以上，必要时外科手术治疗。