肠结核，是结核杆菌侵犯肠道而引起的慢性特异性感染，并不是绝症，经过积极的处理可以治好。在治疗建议以下几点：
第一、要注意休息和营养。休息和营养可以加强病人抵抗力，是治疗的基础。特别是活动性的肠结核病人，需要卧床休息，积极的改善营养。对于消瘦、营养不良或因胃肠道症状而妨碍进食的患者，应该给予静脉注射高营养。
第二、需要进行抗结核的治疗。抗结核治疗要做到早期、联合、适量、规律和全程用药。为使病人早日康复，防止耐药性的发生，以上原则要把握好。
第三、如果出现完全性肠梗阻、急性或慢性肠穿孔引起粪瘘以及肠道大出血，内科治疗无效的患者，应进行外科手术治疗。对于增生型的肠结核，也可以进行手术治疗。