结核菌携带者可以治愈，如果通过合理、规律的抗结核治疗，可以完全治愈。抗结核治疗应该遵循早期、规律、合理、适量、联合的用药原则，治疗的目标不仅是杀菌、避免耐药产生，还要消灭病菌，防止和杜绝复发。在抗结核用药期间，应该在医生的监督下，保证规律的用药。如果偶尔出现未用药时，应该有补救措施，以保证规律用药，避免耐药发生。
目前抗结核药物主要是异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺等，服用药物可能会出现一定的副作用。出现胃肠道刺激症状时，如果不严重，可以不用特殊的治疗，但是要定期检查肝功。如果出现肝功能异常时，要给予保肝治疗，严重时需要停用抗结核药。