胃肠间质瘤是起源于胃肠道的间叶组织肿瘤，其愈后取决于疾病的发展阶段，一般通过积极治疗和控制是不影响寿命的。
通常情况下，在间质瘤小于1cm时往往为良性，这种类型的间质瘤生长较为缓慢，对患者的生活质量以及生存时间都没有明显的影响。但是针对这种间质瘤往往需要加强随诊，如果发现间质瘤迅速增大并伴有出血，应当高度怀疑间质瘤癌变。若间质瘤在2-3cm时，也就是间质瘤的直径达到2-3cm时，则应当进行干预和治疗，所以对于胃肠道间质瘤的患者，如果及时得到有效的随诊和治疗则不会影响患者的生存时间。
在日常生活中如果出现胃肠间质瘤则需尽快到肿瘤科就诊，其治疗主要以手术切除为主。除此之外，因为间质瘤的主要扩散途径是血行转移，较少发生淋巴结转移，所以术中一般无需淋巴结清扫，可采用腹腔镜联合内镜切除间质瘤作为首选手术方式。