股骨颈骨折三个月后臀部出现疼痛，常见以下几种原因：
一、手术瘢痕形成，在股骨颈骨折后通常采用手术治疗，手术过程中需要剥离包括关节囊、肌肉等软组织，在手术后需要修复，容易形成局部瘢痕，刺激神经末梢可以产生臀部疼痛症状。
二、康复训练不到位，股骨颈骨折后需要进行康复训练，恢复臀部肌肉的稳定性和张力。如果康复不到位，仍会产生肌肉痉挛、紧张，从而出现臀部疼痛症状。
三、内固定方式或人工关节不合适，可以导致局部疼痛、肿胀，并且可能会产生关节松动等严重的临床后果。