血氧饱和度低会导致脑缺氧、心脏缺氧、肾缺氧，会出现上述器官功能的减退，如果出现了血氧饱和度低要吸氧，吸氧无效的情况下可以考虑呼吸机治疗，包括有创呼吸机和无创呼吸机。
在上述治疗的同时需要积极的完善相关检查，明确低氧血症的原因，根据原因采取对因治疗，例如是由于慢性阻塞性肺病而出现的低氧血症，可以根据病情采取综合的抗感染、祛痰、平喘等相关治疗。
如果是由于心功能不全而出现的血氧饱和度低，需要进行强心、利尿、扩血管等综合性的治疗，避免使用导致血氧下降的药物。