滴虫性外阴炎常常继发于滴虫性阴道炎。女性的阴道毛滴虫多寄生于阴道、尿道、前庭大腺及膀胱。治疗可以选择全身用药，主要治疗药物为甲硝唑及替硝唑。甲硝唑或者替硝唑2g，单次口服，或者甲硝唑400mg，每日两次，连服七天。口服药物的治愈率为90%-95%。服药后偶尔能够见到胃肠道的反应，如食欲减退、恶心、呕吐等。此外，偶尔能够见到头痛、皮疹、白细胞减少等，一旦发现应该停药。甲硝唑用药期间及停药24小时之内，替硝唑用药期间及停药72小时之内应该禁止饮酒。哺乳期间用药不宜哺乳。因为滴虫主要经过性生活传播，性伴侣应该同时进行治疗。用药期间最好禁性生活。