肛门湿疹要与肛门瘙痒症进行鉴别。肛门瘙痒症是一种常见的局部瘙痒症。肛门部有时会有轻微的发痒，如果瘙痒严重，经久不愈，就会变成瘙痒症，它是一种常见的局限性神经机能障碍，会延伸到阴囊的后方，多发生于20-40岁的中年、老年等等。另外要与肛门夜间奇痒症进行鉴别，像蛲虫病，它就是引起肛门会阴部瘙痒，为特别的一种肠道寄生虫病，是儿童互相传染的常见寄生虫病。肛周的湿疹是一种常见的非传染性皮肤病，病变多局限于肛门周围皮肤，偶有蔓延至臀部、会阴，局部可出现红疹、红斑这些现象，所以要进行鉴别。