临床上测定碱性磷酸酶主要是用于骨骼胆道系统疾病的诊断和鉴别。生理性增高，儿童在生理性的骨骼发育期，碱性磷酸酶可以比正常人高1-2倍，以及进食脂肪含量高的食物也可以升高。病理性的升高，比如骨骼疾病中的佝偻病、软骨病、恶性的肿瘤、骨转移等，这些都会病理性的增高。胆道疾病比如肝外胆道的堵塞、肝硬化、肝癌、某些胆管性的肝炎等。其他的如甲状旁腺功能亢进，这些也是会增高的。此外，长期研究碱性磷酸酶也会升高。以上为肝功能中碱性磷酸酶增高的原因。