肝血管瘤的确切发病原因尚不清楚，主要有以下几个说法：第一、比如先天性的发育异常，因为肝血管瘤的发生是先天性的肝脏末梢血管畸形所致。在胚胎发育过程中，由于肝血管发育异常，而引起血管内皮细胞异常增生，形成肝血管瘤。第二、激素的刺激学说，女性肝血管瘤的患者在青春期、妊娠期以及口服避孕药等都可以使血管瘤的生长速度加快，认为女性的激素可能是血管瘤的一种致病因素。其它的学说，有的人认为毛细血管组织感染后变形，导致毛细血管扩张、肝组织局部坏死后，血管扩张形成空泡状，周围血管充血扩张，肝内的区域性血管血停滞，致使血管形成海绵状的扩张，形成肝内的血管瘤。