淋病和非淋病原体不同，临床的症状也有区别。淋病是由淋病双球菌感染，所引起的性传播疾病，往往发病比较急，对男性而言是感染之后3-5天发病，表现为典型的淋菌性尿道炎，有尿频、尿急、尿痛等症状，尿道口红肿、有明显的黄绿色脓性分泌物。女性症状相对比较轻，但是也有脓性的分泌物产生。
非淋菌性尿道炎主要是由衣原体、支原体等感染所引起，潜伏期1-3周，症状与淋病相比要轻些。对男性来讲也会引起尿道炎，但是通常症状较轻，只是有尿道的轻度刺痒、刺痛、烧灼感。尿道的分泌物通常是浆液性，量比较少，有时候只是早上形成分泌物结痂封住尿道口，或者内裤上有分泌物的污染，一般来讲非淋菌性尿道炎很少有脓性的分泌物产生。