巧克力囊肿主要是子宫内膜的异位症的一种，来月经的时候它会充血增大。这种情况下，主要是根据巧克力囊肿的大小来选择治疗的方案。如果巧克力囊肿小于5cm，一般可以选择观察或者药物治疗，比如选择金刚藤、桂枝茯苓丸或者达那唑胶囊，这些药物进行治疗效果会比较好。同时可以观察，因为怀孕之后巧克力囊肿可能会吸收或消失掉。但是如果巧克力囊肿比较大，＞5cm很容易导致急性出血、破裂或者扭转可能，对于患者的危险是很大的。这个情况下就应该尽早的采取腹腔镜的手术，剔除巧克力囊肿，还可以保存部分的卵巢功能。如果后期越来越大不处理，容易发生破裂，继发腹腔感染，导致子宫内膜异位症广泛播散，导致更严重的并发症。