进行核磁共振检查前先由医生选择适应症，患者在检查前要常规去除身上的金属物品，比如手机、眼镜、假牙、手表、金属饰品或者皮带、纽扣等以免金属影响磁场的均匀性，造成图像干扰而形成伪像。
如果做增强核磁共振检查，患者还要在检查前做对比剂的过敏试验，患者再准备检查床上需要的体位。由操作者一般是核磁共振的技师选择合适的线圈，通过移动磁共振检查床移动到磁体中心再进行检查，准确定位之后可以直接进行扫查。